Podczas II wojny światowej na terenie cmentarza żydowskiego w Czarnym Dunajcu Niemcy dokonywali egzekucji osób pochodzenia żydowskiego. Lokalizacja grobów ofiar Zagłady pozostaje nieznana. Wiadomo, że pochowano tu m.in. Józefa Lehrera wraz z żoną i córką oraz dostarczającego im pożywienia Polaka Karola Chracę, rozstrzelanych przez Niemców 20.05.1942 roku.
| Imię | Nazwisko |
| Anna | Balitzer |
| brak danych | Balitzer |
| Feliks | Balitzer |
| Henryk | Balitzer |
| Karol | Chraca |
| Georg | Jonas |
| Salomea | Jonas |
| Brak danych/kobieta | Kolber |
| Brak danych/mężczyzna | Kolber |
| Nina | Kraus |
| brak danych/żona Józefa | Lehrer |
| Józef | Lehrer |
| Rewka | Lehrer |
| Brak danych/kobieta | Midelgrün |
| Brak danych/żona Natana | Neügewurtz |
| Natan | Neügewurtz |
| Gustaw | Pacanower |
| Syda | Pacanower |
| Brak danych | Süsner |
Źródło: Chrobaryński J., W latach drugiej wojny światowej, [w:] Czarny Dunajec i okolice. Zarys dziejów do 1945 roku, red. F. Kiryk, Kraków 1997, s. 449; Encyclopaedia of Jewish Communities. Poland, t. 3, Western Galicia, Silesia, red. A. Wein, A. Weiss, Jerozolima 1984, ss. 302–303; Ogólnopolska komputerowa baza cmentarzy wojennych: Mogiła zbiorowa Karola Chracy i Żydów ofiar terroru hitlerowskiego w Czarnym Dunajcu, [w:] Rada Ochrony Pamięci Walk i Męczeństwa [online] http://groby.radaopwim.gov.pl/grob/7018/ [dostęp: 18.10.2013].
