Jedyna czynna synagoga Wilna – Synagoga Chóralna (lit. Vilniaus choralinė sinagoga) znajduje się przy ul. Zawalnej – lit. Pylimo g. 39.
Powstanie Synagogi Chóralnej wiązało się z rozwojem haskali w Wilnie. Pierwsza bóżnica pod tą nazwą, istniejąca od 1846 r., a znana też jako Taarat ha-Kodesz, nie miała początkowo swojej siedziby. Zmieniło się to w 1899 r., gdy społeczność postępowa zakupiła grunt pod synagogę przy ul. Zawalnej, należący uprzednio do kupca W. Eliaszberga.
Autorem pierwszego projektu był w 1901 r. Alieksiej Połozow (nie wymieniany przez wszystkie źródła). W latach 1902–1903 zrealizowano jednak projekt Dawida Rozenhausa. Synagoga, będąca budowlą typu bazylikowego, stanowi przykład popularnego na przełomie wieków tzw. stylu mauretańskiego. Posiada dwie galerie wewnętrzne – jedną dla kobiet, drugą dla chóru. Budziła wśród współczesnych rożne opinie; jednym z jej przeciwników był znawca Wilna Juliusz Kłos, który pisał w 1923 r.: „Nowa Synagoga chóralna (Targarot-Ha-kodasz) przy ul. Zawalnej, zbudowana w 1903 r. zatraciła wszelki związek z tradycją bóżnic żydowskich w Polsce i jest banalnym, międzynarodowym gmachem o formach, roszczących pretensje do »stylu maurytańskiego«”[1.1].
Uroczyste otwarcie nastąpiło w święto Rosz ha-Szana w 1903 roku. Ceremonię prowadził chazan Abraham Bernstein, a gościem honorowym był historyk Szymon Dubnow. Otwarcie synagogi uświetniło przekazanie jej obszernej biblioteki, należącej do Szlomo Załkinda Minora, wcześniej rabina Mińska i Moskwy. W latach 1904–1906 kaznodzieją synagogi był wybitny działacz na rzecz praw Żydów w Rosji Szamaria Lewin. W latach 1920 – 1924 funkcję kantora pełnił słynny później Mosze Kusewicki (Moshe Koussevitzky).
Zamknięta w 1941 r., przetrwała okupację jako niemiecki magazyn leków, choć jej wyposażenie zostało rozgrabione. Po 1945 r. mieściła warsztat ślusarski. Brak opieki spowodował liczne uszkodzenia, m.in. dachu i ścian, a także zawilgocenie. Dopiero w 1989 r. zwrócono ją gminie żydowskiej. W 1994 r., po gruntownym remoncie powróciła do funkcji kultowych. W latach 2008–2010 i 2017 przeprowadzono kolejne prace konserwatorskie. Od początku 2016 r. posługę w synagodze pełni rabin Szymon Daniel Izakson.
